基于高通量测序的极小种群野生植物长梗杜鹃转录组分析

来源 :植物研究 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangwenda_gz
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为加强特有濒危植物长梗杜鹃资源的评价、保护和鉴定工作,及为今后遗传育种和改善其农艺性状提供有益参考。本研究采用新一代高通量测序平台Illumina HiSeq 4000对其转录组测序,得到的数据过滤后进行denovo组装并聚类去冗余,获得74092个Unigenes,平均长度、N50、Q20、Q30以及GC含量分别为938nt、1616nt、98.22%、95.20%和43.24%,其中1Kb以上的Unigenes有23879条。通过与七大功能数据库比对,分别有39876(NR:53.82%)、38065
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