【摘 要】
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目的 获取谷胱甘肽过氧化物酶1(glutathione peroxidase 1,GPX1)在乳腺癌组织表达水平的数据,运用生物信息学方法研究GPX1及其共表达基因在乳腺癌发生发展过程中的作用.方法
【机 构】
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510010 广东广州 ,南部战区总医院检验科
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目的 获取谷胱甘肽过氧化物酶1(glutathione peroxidase 1,GPX1)在乳腺癌组织表达水平的数据,运用生物信息学方法研究GPX1及其共表达基因在乳腺癌发生发展过程中的作用.方法 利用UALCAN数据库收集乳腺癌患者组织中GPX1在癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)中的表达数据,分析GPX1潜在的生物学功能和生存曲线;检索GPX1的共表达基因,对GPX1的共表达基因进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.结果 GPX1的共表达基因包括TYROBP、CTSA、RNASET2、CKLF、AP2S1等;GO富集分析发现GPX1的共表达基因参与细胞增殖、分化、代谢、凋亡、免疫反应等多个生物过程;KEGG通路分析表明GPX1的共表达基因显著富集在T细胞受体信号通路、癌症中程序性死亡受体-配体1(programmed cell death-ligand 1,PD-L1)的表达过程、程序性死亡受体1(programmed cell death 1,PD-1)检查点通路、核因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)信号通路、磷脂酶D信号通路、转化生长因子 β(transforming growth factor-β,TGF-β)信号通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)信号通路以及Janus激酶/信号转导与转录激活子(Janus kinase/signal transducer and activator of tranions,JAK/STAT)信号通路等.结论 GPX1及其共表达基因可能通过影响乳腺癌患者体内细胞的生长代谢,参与乳腺癌的发生与发展过程中的分子调控网络.
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