粗糙脉孢菌基因组分泌蛋白的初步分析

• 作 者: 周晓罡 李成云 赵之伟 苏源 张绍松 李进斌 杨静 刘林 业
• 机 构: 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室,云南省农业科学院农业环境资源研究所,云南大学省部共建生物资源保护与利用国家重点实验室培育基地
• 出 处: 遗传
• 发表日期: 2006年2期
• 关键词: 粗糙脉孢菌 信号肽 分泌蛋白 Neurospora crassa signal peptide secreted proteins
• 基金项目: 国家自然科学基金（编号：30360061）和云南省自然科学基金重点项目（编号：1999C0008Z）资助.

利用信号肽预测软件Signal Pv3．0和PSORT，跨膜螺旋结构预测软件TMHMMv2．0和THUMBUP，GPI．锚定位点预测软件big-PI Predictor和亚细胞器中蛋白定位分布预测软件Target Pv1．01对粗糙脉孢菌全基因组数据库中已公布的10082个氨基酸序列进行预测分析。结果表明，在粗糙脉孢菌中有437个蛋白为分泌蛋白，编码这些蛋白最小的可读框（open reading frame，ORF）为252bp，最大为6604bp，平均1433bp，分泌蛋白信号肽长度介于15～59个氨基