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分析回顾了莲科的系统位置、莲品种分类的现状与问题和莲的遗传多样性。莲科（Nelumbonaceae）植物传统上被归入睡莲科（Nymphaeaceae）。许多研究表明，莲科与睡莲科在形态、细胞、孢粉等方面差异很大，因而建立莲科，置于睡莲目（Nymphaeales）、毛茛目（Ranunculales）或莲目（Nelumbonales）中。分子系统学研究发现，睡莲科为被子植物的基部类群之一，而莲科则是真双子叶植物的基部类群之一，与山龙眼科和悬铃木科有密切关系。莲科含莲（Ndumbo nucifera）和美洲黄莲