【摘 要】
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目的 基于GEO数据筛选卵巢癌患者对紫杉醇耐药的基因分子机制和治疗药物并进行实验验证.方法 利用GEO数据库下载卵巢癌紫杉醇耐药基因芯片GSE28784和GSE15372,通过R和Bioconductor筛选共同差异表达基因并进行GO和KEGG分析.分析卵巢癌紫杉醇耐药的基因分子机制,采用ConnectivityMap筛选紫杉醇耐药卵巢癌患者的治疗药物并进行验证.结果 GSE15372和GSE28784数据集筛选共同差异表达基因,其中上调143个,下调83个.GO分析显示,共同差异表达基因参与DNA复制和
【机 构】
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西北妇女儿童医院药剂科,西安 710061
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目的 基于GEO数据筛选卵巢癌患者对紫杉醇耐药的基因分子机制和治疗药物并进行实验验证.方法 利用GEO数据库下载卵巢癌紫杉醇耐药基因芯片GSE28784和GSE15372,通过R和Bioconductor筛选共同差异表达基因并进行GO和KEGG分析.分析卵巢癌紫杉醇耐药的基因分子机制,采用ConnectivityMap筛选紫杉醇耐药卵巢癌患者的治疗药物并进行验证.结果 GSE15372和GSE28784数据集筛选共同差异表达基因,其中上调143个,下调83个.GO分析显示,共同差异表达基因参与DNA复制和代谢过程、胆固醇代谢、染色体细胞组分、辅酶结合及腺嘌呤核苷酸结合等分子功能.KEGG结果显示,共同差异表达基因参与细胞周期、蛋白酶体及萜类化合物骨架生物合成等肿瘤信号通路.与紫杉醇耐药卵巢癌相关的关键基因有CDK2,MCM4,hMSH2,JUN及AREG.根据ConnectivityMap模块分析结果,确定潜在候选药物为血根碱.1.0,3.0及5.0μmol/L血根碱组、紫杉醇组及空白对照组的卵巢癌细胞增殖率和侵袭数目比较,差异具有统计学意义(F=189.265,95.127,均P<0.001).不同浓度血根碱组的卵巢癌细胞增殖率和侵袭数目显著低于紫杉醇组和空白对照组,差异均有统计学意义(t=2.341～8.720,均P0.05).不同浓度血根碱组组间卵巢癌细胞增殖率和侵袭数目比较,差异具有统计学意义(t=2.380～5.677,均P<0.05).结论 卵巢癌紫杉醇耐药与CDK2,MCM4,hMSH2,JUN及AREG关键基因有关,血根碱能有效抑制卵巢癌细胞的增殖、侵袭,有望成为紫杉醇耐药卵巢癌患者的治疗新药.
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