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真核细胞中，一定数量和种类的ＴＢＰ相关因子与ＴＢＰ结合成多蛋白复俣物－－基本起始因子ＳＬ１、ＴＦⅡＤ、ＴＦⅢＢ，分别指导三类基因的转录，因此，ＴＢＰ是一种通用转录子，而ＴＡＦｓ则具有聚合酶和启动子特异性，起辅助转录激活因子的作用。在转录起始过程中，前者在种属间高度保守的Ｃ端独特结构可直接识别ＴＡＴＡ元件，或通过ＴＡＦｓ与ＤＮＡ结合；而后者有的作为ＴＢＰ结合ＤＮＡ的媒介，有的作为转录起始复合物组装时