PCR-DGGE鉴定短程硝化与反硝化系统的亚硝酸菌

• 作 者: 夏峰峰 姚秀清 张全 吕英杰 佟明友
• 机 构: 辽宁石油化工大学环境与生物工程学院,中国石化抚顺石油化工研究院,中国科学院沈阳应用生态研究所
• 出 处: 环境科学与技术
• 发表日期: 2009年B06期
• 关键词: PCR-DGGE 16S RDNA 亚硝酸菌 同源性分析 PCR-DGGE 16S rDNA nitritebacteria homology analysis

现代分子生物学技术PCR-DGGE是一种分析微生物群落的有效工具，可以用于研究生态系统中微生物多样性。首先运用传统方法分离培养亚硝酸菌群，提取DNA后通过PCR-DGGE技术对16S rDNA进行PCR扩增，结合DGGE，鉴定短程硝化与反硝化系统中的亚硝酸菌群。用NCBI-Blast软件将测序结果在Genbank数据库中进行同源性检索，测序结果经检索证实亚硝酸菌优势菌与标准菌株Nitrosomonas eutropha C91的保守性片段有87％的同源性，传统培养方法结合PCR-DGGE测序技术是一种可行