庚型肝炎病毒RNA NS3区基因分型

来源 :北京医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:feng_lingpeng
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目的:探讨HGVNS3区基因变异与基因型的关系。方法:对32株NS3区序列进行酶切位点分析,比较中国株与GBV-C株和已发表的HGVNS3区酶切位点,选择特异性内切酶切点。结果:32株NS3序列酶切位点分析表明存在5种基因型。1组:在4338位无HhaI切点,而在4360位有HhaI切点;2组:4338位及4360位均无HhaI切点;3组:仅在4338位有HhaI切点;4组:4338位及4351位有HhaI及Tsp509I切点;5组:4351位有Tsp509I切点。其核苷酸变异率分别为0.85%、19.0%、20.5%、18.2%、19.6%等。结论:中国株与西非、东非、加拿大、美国及日本株不是同一基因型。 Objective: To investigate the relationship between HGVNS3 gene mutation and genotypes. Methods: 32 NS3 sequences were analyzed by restriction enzyme digestion. The restriction sites of Chinese strain, GBV-C strain and published HGVNS3 region were compared and the specific endonuclease cleavage sites were selected. Results: The analysis of 32 NS3 restriction sites showed that there were 5 genotypes. Group 1: No HhaI at 4338 and HhaI at 4360; 2: No HhaI at 4338 and 4360; 3: HhaI at 4338 only; 4: 4338 There were HhaI and Tsp509I point at 4351 and 5 points: Tsp509I at 4351. The nucleotide variation rates were 0.85%, 19.0%, 20.5%, 18.2%, 19.6% and so on. Conclusion: Chinese strains are not the same genotype as West Africa, East Africa, Canada, USA and Japan.
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