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深圳是全国承担开展省级政府教育统筹综合改革试点的唯一副省级城市和计划单列市。他们对这项改革的基本思路是，以教育体制改革为主线，统筹特区教育一体化发展，统筹编制教育发展规划，统筹建立健全以政府投入为主、多渠道筹集教育经费、保障教育投入稳定增长的体制机制，转变政府办教育管教育的方式，强化教育体制机制活力，强化学校自主内涵发展动力，促进教育与经济社会协调发展、各级各类教育协调发展。
实施方案与改革目标
2010年11月，深圳市向国家教育体制改革领导小组办公室报送了省级政府教育统筹综合改革试点《项目任务书》，把推进省级政府教育统筹综合改革试点，纳入市、区党政领导干部基础教育工作责任考核。从组织领导、工作机制、目标任务到责任分工、任务落实、进度安排等，都扎实推进省级政府教育统筹综合改革试点工作。2010年12月，《深圳市省级政府教育统筹综合改革试点实施方案》出台，明确了省级政府教育统筹综合改革的各项任务。其中提出：统筹规划全市教育事业发展，统一全市中小学校建设标准，统一实行中小学生均拨款制度，统一实施中小学办学水平评估。高水平推进教育基本公共服务均等化。探索完善居深人口平等接受义务教育政策。实行非深圳户籍和深圳户籍适龄人口按统一程序网上申请免试就近入学，确保符合入学条件者大部分安排入读公办学校，选择就读民办学校的也按统一规定实行义务教育免费。
与此同时，自2011年起，深圳市全面开征地方教育附加，首次将城市土地出让金收益10%用于教育发展。健全教育经费多元筹措机制，鼓励国内外界人士及机构捐资助学办学，多渠道筹措教育发展基金，统筹建立健全教育投入稳定增长体制机制。
推进特区教育一体化
深圳市很早就颁布实施了全市统一的教育资源配置标准。2011年1月，深圳市政府出台《关于优化深圳市义务教育财政投入结构的意见》，实现全市各区范围之内学校统一生均经费标准。2013年，全市义务教育阶段公办学校除人员经费以外的日常运行费用，将实行统一的生均拨款制度，并建立学校生均拨款标准调整长效机制，根据经济社会发展水平和物价水平适时调整生均拨款标准。同时，还逐步建立起全市统一的义务教育阶段公办学校设备设施配置标准及价格标准。
此外，还统筹推进学校均衡优质发展，统筹推进学校内涵特色发展，统筹公、民办教育协调发展，切实解决外来务工人员子女上学问题。对外来务工人员子女义务教育，深圳坚持做到“四个统一”：统一学位申请，非深圳户籍儿童可与深户适龄儿童一样，不分户籍，按统一程序网上申请免试就近入学，学校招生计划、招生地段、招生条件、招生结果均面向社会公开；统一免费管理，符合入学条件者大部分安排入读公办学校，选择就读民办学校的也按统一规定实行免费；统一学籍管理，全市公办、民办中小学校学生学籍联网管理；统一教育管理，平等实施教育教学。
优化转移支付
根据深圳市教育局发表的数据来看：2016年深圳市教育局部门预算收入280767万元，比2015年增加91682万元，增长48%。而，2016年预算编制口径变化成为此次预算收支增加的主要原因之一，其中，教育费附加40154万元、政府投资8000万元和政府性基金项目7786万元新纳入预算编制范围。
2016年3月，为进一步做好深圳市2016年教育经费转移支付有关工作，优化支付流程，加快预算执行进度，深圳市财政委文教处组织召开市、区财政和教育部门优化教育经费转移支付方式专题座谈会，市教育局计划发展处、各区（含新区，下同）财政局和教育局相关负责同志参加了会议。
会议总结了2015年市教育主管部門申请市级统筹教育费附加转移支付给各区的情况，指出市级统筹教育费附加转移支付存在批次多、项目繁杂等问题。一方面大大地增加了市、区财政部门的工作量；另一方面，因资金下达和文件通知不同步，各区流程也存在差异，资金支付效率低，不利于加快预算执行进度。针对2015年存在的问题，深圳市财政委文教处提出2016年优化转移支付流程的设想，年初由深圳市财政委会同深圳市教育局将转移支付给各区的教育经费盘子一次性告知各区财政和教育部门，具体项目则由深圳市教育局根据各项工作的进度另行发文通知区教育部门，并抄送深圳市财政委和各区财政局，各区财政部门在年初深圳市财政委转移支付的资金盘子内执行。
实施方案与改革目标
2010年11月，深圳市向国家教育体制改革领导小组办公室报送了省级政府教育统筹综合改革试点《项目任务书》，把推进省级政府教育统筹综合改革试点，纳入市、区党政领导干部基础教育工作责任考核。从组织领导、工作机制、目标任务到责任分工、任务落实、进度安排等，都扎实推进省级政府教育统筹综合改革试点工作。2010年12月，《深圳市省级政府教育统筹综合改革试点实施方案》出台，明确了省级政府教育统筹综合改革的各项任务。其中提出：统筹规划全市教育事业发展，统一全市中小学校建设标准，统一实行中小学生均拨款制度，统一实施中小学办学水平评估。高水平推进教育基本公共服务均等化。探索完善居深人口平等接受义务教育政策。实行非深圳户籍和深圳户籍适龄人口按统一程序网上申请免试就近入学，确保符合入学条件者大部分安排入读公办学校，选择就读民办学校的也按统一规定实行义务教育免费。
与此同时，自2011年起，深圳市全面开征地方教育附加，首次将城市土地出让金收益10%用于教育发展。健全教育经费多元筹措机制，鼓励国内外界人士及机构捐资助学办学，多渠道筹措教育发展基金，统筹建立健全教育投入稳定增长体制机制。
推进特区教育一体化
深圳市很早就颁布实施了全市统一的教育资源配置标准。2011年1月，深圳市政府出台《关于优化深圳市义务教育财政投入结构的意见》，实现全市各区范围之内学校统一生均经费标准。2013年，全市义务教育阶段公办学校除人员经费以外的日常运行费用，将实行统一的生均拨款制度，并建立学校生均拨款标准调整长效机制，根据经济社会发展水平和物价水平适时调整生均拨款标准。同时，还逐步建立起全市统一的义务教育阶段公办学校设备设施配置标准及价格标准。
此外，还统筹推进学校均衡优质发展，统筹推进学校内涵特色发展，统筹公、民办教育协调发展，切实解决外来务工人员子女上学问题。对外来务工人员子女义务教育，深圳坚持做到“四个统一”：统一学位申请，非深圳户籍儿童可与深户适龄儿童一样，不分户籍，按统一程序网上申请免试就近入学，学校招生计划、招生地段、招生条件、招生结果均面向社会公开；统一免费管理，符合入学条件者大部分安排入读公办学校，选择就读民办学校的也按统一规定实行免费；统一学籍管理，全市公办、民办中小学校学生学籍联网管理；统一教育管理，平等实施教育教学。
优化转移支付
根据深圳市教育局发表的数据来看：2016年深圳市教育局部门预算收入280767万元，比2015年增加91682万元，增长48%。而，2016年预算编制口径变化成为此次预算收支增加的主要原因之一，其中，教育费附加40154万元、政府投资8000万元和政府性基金项目7786万元新纳入预算编制范围。
2016年3月，为进一步做好深圳市2016年教育经费转移支付有关工作，优化支付流程，加快预算执行进度，深圳市财政委文教处组织召开市、区财政和教育部门优化教育经费转移支付方式专题座谈会，市教育局计划发展处、各区（含新区，下同）财政局和教育局相关负责同志参加了会议。
会议总结了2015年市教育主管部門申请市级统筹教育费附加转移支付给各区的情况，指出市级统筹教育费附加转移支付存在批次多、项目繁杂等问题。一方面大大地增加了市、区财政部门的工作量；另一方面，因资金下达和文件通知不同步，各区流程也存在差异，资金支付效率低，不利于加快预算执行进度。针对2015年存在的问题，深圳市财政委文教处提出2016年优化转移支付流程的设想，年初由深圳市财政委会同深圳市教育局将转移支付给各区的教育经费盘子一次性告知各区财政和教育部门，具体项目则由深圳市教育局根据各项工作的进度另行发文通知区教育部门，并抄送深圳市财政委和各区财政局，各区财政部门在年初深圳市财政委转移支付的资金盘子内执行。