论文部分内容阅读
目的 研制肝癌多种相关基因芯片 ,进行肝癌组织中基因编码区单核苷酸多态性(cSNP)检测分析研究。方法 选取定位于肝癌高频缺失区的基因 ,经NCBIdbSNP数据库查询 ,获得基因cSNP序列 ,且根据多态位点设计寡核苷酸探针 ,制备成含 2 5个肝癌相关基因的 4 8个cSNP芯片。并对 10例肝癌患者cSNP进行检测分析 ,而对 7例患者的部分检测结果用聚合酶链反应 单链构象多态性法 (PCR SSCP)和测序进行验证。结果 芯片检测的灵敏度为 6× 10 3 ng/ μl,检测重复率高于 95 83% ,随探针浓度降低 ,杂交信号逐渐减弱。 10份肝癌患者组织中 ,检测到半胱氨酸酶caspase9(rs2 30 894 1)C→T多态性和停泊蛋白DOK2 (rs2 2 4 2 2 4 1)T→G各 7份 ,表皮生长因子类似物EGFL3(rs94 7345 )A→G多态性、caspase9(rs2 30 8938)C→G多态性和磷酸甘油酸盐脱氢酶PHGDH(rs180 195 5 )T→A多态性各 6份 ,启动子结合因子E2F2 (rs32 18170 )G→A多态性 5份 ,DNA切除修复糖基化酶MUTYH(rs114 0 5 0 7)T→C和胞内蛋白BNIP3L(rs10 5 5 80 6 )G→T多态性 4份 ,肿瘤坏死因子家族成员TNFRSF1B (rs10 6 16 2 2 )T→G多态性 1份。经PCR SSCP检测 ,7例肝癌患者有多态性单链迁移率改变。选取有caspase9(rs2 30 894 1G)与 (rs2 30 894 1A)的样本分别连