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本研究以天然无咖啡碱南昆山毛叶茶为主要研究材料，以不同咖啡碱含量的英红9号茶树品种和红山茶等山茶属植物为对照，采用RT-PCR技术，克隆获得南昆山毛叶茶、英红9号和福云6号茶树品种的NMT基因全长，分别编码365、369和369个氨基酸。序列比较分析表明南昆山毛叶茶NMT基因与其它茶树NMT基因的核苷酸序列同源性高于86．5％，氨基酸序列同源性高于86．3％，并包含了六个保守序列、三个SAM结合区A、B’、C及一个保守域VFFF。基于同源性比较，推测核苷酸序列的差异可能是导致南昆山毛叶茶NMT基因活性改变