【摘 要】
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目的 基于二代测序技术分析结肠癌组织中miRNA-186的表达差异,采用生物信息学方法分析其靶基因及表达调控网络。方法 收集2015年6月至2016年8月我院收治的40例结肠癌患者和同
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目的 基于二代测序技术分析结肠癌组织中miRNA-186的表达差异,采用生物信息学方法分析其靶基因及表达调控网络。方法 收集2015年6月至2016年8月我院收治的40例结肠癌患者和同期40例健康者,利用二代测序技术检测其中3例结肠癌和癌旁组织中差异miRNA,并绘制差异miRNA热图聚类图。应用miRBase数据库预测miRNA-186的靶基因,利用Cytoscape进行GO基因注释(gene ontology),利用KEGG公共数据库进行信号通路富集。利用miRNet数据库绘制miRNA与基因的表达调控网络。结果 测序结果显示,结肠癌组织中miRNA-186表现为上调。GO功能注释主要富集在调控翻译起始、RNA聚合酶结合、酰基辅酶A代谢、Smad蛋白磷酸化调节通路等生物学过程和分子功能中(P<0.05);KEGG信号通路富集主要涉及NOTCH信号通路、TOR信号通路、BMP信号通路、Hippo信号通路中(P<0.05)。互作网络显示,miRNA-186靶向基因大多数与细胞的代谢有关。结论 老年原发性结肠癌组织中miRNA-186表达水平上调,作为结肠癌的促癌因子,miRNA-186的靶基因、功能注释和通路富集于与消化道系统肿瘤相关的生物信息中。
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