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胃肠道是人体内菌群的储存库。肠道菌群与人体构成共生关系，不仅参与营养物质代谢、机体免疫系统的发育和肠道屏障功能等正常生理过程，也与人体的多种疾病发生进展特别是胃肠道肿瘤的发病密切相关。同时肠道菌群影响着肿瘤的放疗、化疗和免疫治疗的疗效和毒副反应。随着基因测序技术和生物信息学的发展和普及化，探索肠道菌群与胃肠道肿瘤发生发展及治疗的关系是近年来的研究热点并为胃肠道肿瘤的预防和诊治提供新的方法和思路。