【摘 要】
：
目的:基于特征图谱、网络药理学及分子对接技术,对黄连异喹啉类生物碱成分治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在作用机制进行预测分析.方法:利用高效液相色谱法对黄连全株药材不同部位的异喹啉类生物碱成分进行定量测定,建立HPLC特征图谱.借助TCMSP数据库、Swiss Target Prediction数据库及Uniprot数据库筛选和分析黄连目标化合物及作用靶点,通过Genecards、OMIM、TTD和Drugbank数据库筛选出T2DM疾病靶点基因,使用STRING数据库绘制靶点蛋白-靶点蛋白相互作用网络,对
【机 构】
：
西南交通大学生命科学与工程学院,成都610031
论文部分内容阅读
目的:基于特征图谱、网络药理学及分子对接技术,对黄连异喹啉类生物碱成分治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在作用机制进行预测分析.方法:利用高效液相色谱法对黄连全株药材不同部位的异喹啉类生物碱成分进行定量测定,建立HPLC特征图谱.借助TCMSP数据库、Swiss Target Prediction数据库及Uniprot数据库筛选和分析黄连目标化合物及作用靶点,通过Genecards、OMIM、TTD和Drugbank数据库筛选出T2DM疾病靶点基因,使用STRING数据库绘制靶点蛋白-靶点蛋白相互作用网络,对交集靶点蛋白利用Metascape数据库进行GO基因生物学功能和KEGG通路分析,采用Cytoscape 3.7.2软件构建“化合物-靶点-通路”关系网络,最后运用AutoDock Vina软件对核心靶点与作用化合物进行分子对接验证.结果:测定了黄连全株药材不同部位的6种异喹啉类生物碱成分含量,建立了黄连不同部位的HPLC特征图谱,并指认6个特征色谱峰.结合网络药理学分析发现,黄连治疗T2DM的核心靶点有32个,分别是PIK3CA、PIK3R1、SRC、STAT3和MCHR1等,核心作用化合物有10个,分别为氢化小檗碱、小檗红碱、小檗浸碱、小檗碱和药根碱等.GO功能富集在155条细胞组分、2366条生物过程和266条分子功能,主要涉及以醇基为受体的磷酸转移酶活性、蛋白质酪氨酸激酶活性、受体复合体、转移酶活性的正调控、细胞对氮化合物的响应、肽基-丝氨酸修饰、顺行突触信号转导、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路、肽基-酪氨酸磷酸化等方面.KEGG富集主要涉及癌症途径、神经活性配体-受体相互作用、乙型肝炎、血清素能突触、Th17细胞分化、胰岛素抵抗等348条作用通路.分子对接验证结果显示,分子结合能＜-5 kcal/mol的占86.67％,氢化小檗碱与MCHR1亲和力最好,结合能达到-8.7 kcal/mol.结论:本研究初步确定了黄连全株药材不同部位生物碱成分组成分布.同时揭示了黄连异喹啉类生物碱成分通过多靶点相互作用,参与多通路的调控以达到治疗T2DM的作用机制,并以分子对接进行验证,为临床运用黄连治疗T2DM提供理论依据.
其他文献
目的:研究表明错误折叠蛋白的聚集是神经退行性疾病的病因所在,而自噬溶酶体是清除错误折叠蛋白缓解神经退行性疾病进程的重要途径,本研究旨在从来源丰富多样的具有潜在神经保护功能的中药中筛选自噬激活剂,以为后期中药神经保护剂的开发奠定基础.方法:从《中华本草》中选取记载有对中枢神经系统具保护作用的149味中药,使用75％乙醇回流提取并浓缩干燥后得到中药的总提取物,并以DMSO溶解配置成一定浓度的母液;应用MTT法测定中药总提取物对PC-12细胞的IC50以确定药物的作用浓度;应用pEGFP-LC3质粒稳定转染的H
目的:探讨蜘蛛香挥发油对脂多糖诱导小胶质细胞活化的抑制作用及可能机制.方法:建立脂多糖诱导小胶质细胞活化模型,并用不同剂量的蜘蛛香挥发油处理,MTT法检测细胞活力,ELISA法检测IL-6的分泌,实时荧光定量PCR检测Il-6、Il-1β、Nf-κb和Iκbα激酶的mRNA表达水平,Western Blot检测IL-6、IL-1β、NF-κB、IκBα激酶及其磷酸化蛋白的相对表达.结果:与正常对照组比较,模型对照组的IL-6含量显著升高(P＜0.01),IL-6、IL-1β、核因子κB的蛋白表达以及mRN
目的:玉米须水煎液对高脂血症大鼠肝损伤的改善作用,并结合代谢组学探讨其作用机制.方法:通过喂高脂饲料4w后建立高脂血症模型,将成模大鼠给予立普妥3 mg/kg、玉米须2.7、5.4、10.8 g/kg灌胃给药,给药8w后,检测大鼠三酰甘油(TG)、胆固醇(TC)、低密度脂蛋白(LDL-C)、高密度脂蛋白(HDL-C)、游离脂肪酸、谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)水平和肝组织病理状态,并采用UPLC/Q-TOF-MS技术,结合主成分分析和正交偏最小二乘法-判别分析方法,分析肝组织代谢谱的变化.结果
目的:制备胶原诱导类风湿关节炎(CIA)大鼠模型,探讨桄榔子醇提物抗类风湿关节炎的作用及机制.方法:60只SPF级SD大鼠,随机分为模型对照组和正常对照组、桄榔子醇提物4.5、2.25、1.13 g/kg组、雷公藤多苷片0.018 g/kg组,每组10只.除正常对照组外,其余各组大鼠在尾根部多点皮内注射牛Ⅱ型胶原乳浊液,建立CIA模型.初次免疫开始灌胃给药,连续28 d.每5d测定大鼠体重、足肿胀体积;HE染色观察大鼠脾脏、踝关节病理变化情况;ELISA法测定各组大鼠血清中肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、
目的:探讨三叶香茶菜对四氯化碳(CCl4)致肝纤维化大鼠炎症小体3(NOD-like receptor family pyrin domain-contai-ning 3,NLRP3)/半胱天冬酶-1(Caspase-1)/消皮素D(gastermin D,GSDMD)信号通路的作用.方法:采用CCl4致大鼠肝纤维化模型,给予三叶香茶菜治疗后,分别生化检测血清谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)的活力、超氧化物歧化酶(SOD)活力及丙二醛(MDA)含量.酶联免疫吸附法(ELISA)检测大鼠血清透明质
目的:探究蒙古扁桃油对肺纤维化大鼠的影响.方法:将60只SPF级雄性SD大鼠按体重随机分为6组:正常对照组、模型对照组、醋酸泼尼松0.0015 g/kg组、蒙古扁桃油5、10、15 g/kg组.除正常对照组外,其他各组通过气管内滴注博莱霉素5 mg/kg建立肺纤维化模型,各组连续灌胃相应药物或生理盐水28 d后摘取肺组织用于苏木素-伊红(HE)、马森(Masson)等组织病理学分析及检测肺脏器指数、肺组织白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素.-1β(IL-1β)、Ⅲ型胶原(COL-Ⅲ)、Ⅳ型胶原(COL
目的:研究艾片对脑缺血再灌注损伤(CIRI)大鼠的脑保护作用及机制.方法:采用防治结合给药方式对线栓法制备的脑缺血再灌注模型大鼠进行干预,测量不同时间点(再灌注4h、22.5 h、46.5 h和70.5 h)模型大鼠的体温,观察其体温变化;根据mNss评分法对模型大鼠不同时间点(与体温同步)神经功能进行评价;苏木精-伊红(Hematoxylin-eosin,HE)染色法观察模型大鼠缺血侧脑组织病理形态;酶联免疫吸附法检测模型大鼠血清中锰-超氧化物歧化酶(Mn-Superoxide dismutase,Mn
目的:探讨黎药鹧鸪茶治疗高脂血症(HLP)作用机制.方法:取SPF级SD大鼠60只,随机分为正常对照组、模型对照组、运动组及鹧鸪茶1.7、2.5、3.3 g/kg组,每组10只,除正常对照组外其余各组采用高脂饲料喂养8w建立高脂血症大鼠模型.动物模型建成后,给药组灌胃给予相应药物,正常对照组与模型对照组给予蒸馏水灌胃,运动组予游泳干预治疗.上述干预进行4w后,采集大鼠血液及肝脏组织,检测血脂水平、肝脏氧化应激指标、肝脏组织油红染色并使用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)法测定肝组织中胞浆蛋白伴侣分
目的:研究新鲜唐古特大黄茎对小鼠的急性毒性及泻下作用,为大黄茎的安全性评价和后续毒理药效实验提供参考.方法:以SPF级KM种小鼠为受试对象,测定其最大耐受量.给药后观察小鼠在14d内所产生的毒性反应(死亡、中毒症状)及恢复情况等,同时记录各组动物给药后的体质量变化和摄食饮水情况;14 d后,测定血清中尿素氮(BUN)、肌酐(Cr)、总胆红素(TBIL)、谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、碱性磷酸酶(ALP)的水平,称量各组织质量并计算其脏器系数,苏木素-伊红(HE)染色观察各组织脏器的病理学变化
目的:通过网络药理学研究探讨半枝莲抗结直肠癌的作用机制,并通过实验验证相关靶点.方法:借助TCMSP数据库检索半枝莲的化学成分和相关靶点.通过蛋白质数据库Uniprot查询对应的基因名,运用Cytoscape3.6.0构建半枝莲的成分-靶点网络,基于KEGG信号通路和GO富集分析,预测半枝莲抗结直肠癌的作用机制.选取结肠癌细胞HCT116进行MTT、划痕、Tran-swell以及蛋白免疫印迹法验证半枝莲抗结直肠癌的作用机制.结果:检索出半枝莲化学成分主要包括黄芩苷、黄芩黄酮以及槲皮素等;筛选出关键靶基因2