【摘 要】
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目的 了解广州地区丙型肝炎病毒(HCV)主要流行基因型E1蛋白胞外域氨基酸序列突变特征.方法 采集2012-2018年380例广州地区HCV感染者血液标本,使用试剂盒提取HCV RNA,进行Core
【机 构】
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南方医科大学检验与生物技术学院输血医学系,广东广州510515;广州血液中心;广州市医学重点实验室(血液安全重点实验室)
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目的 了解广州地区丙型肝炎病毒(HCV)主要流行基因型E1蛋白胞外域氨基酸序列突变特征.方法 采集2012-2018年380例广州地区HCV感染者血液标本,使用试剂盒提取HCV RNA,进行Core/E1区序列巢式PCR扩增和测序,采用Mega 7.0构建系统进化树进行基因分型,对广州地区流行的HCV主要基因型的E1胞外域部分序列进行氨基酸翻译和构建共有序列,利用生物信息软件、统计软件分析HCV E1胞外域氨基酸位点突变的分布特征、替换模式及与宿主免疫的关系.结果 广州地区HCV主要流行基因型为1b和6a,分别占38.68％和41.84％;1b和6a基因型E1蛋白胞外域(aa 192-320)发生突变的氨基酸位点分别有62个(48.1％)和60个(46.5％),差异无统计学意义(x2=2.04,P＞0.05);突变主要发生在aa 192-260区段,1b型的高度突变位点(突变率≥20％)比较分散,6a型则集中在aa231-243区段;高度突变位点均处于免疫表位区,BLOSUM评分显示大部分突变位点氨基酸替换模式为保守性替换.结论 HCV基因型1b和6a蛋白E1胞外域的高度突变位点主要位于免疫表位区,大部分突变为保守性替换而且种类多样,可能与免疫压力有关.
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