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水稻恶苗病从苗期至抽穗期均可发生，一般有三个较明显的发病高峰期，在播种后15天左右出现第一个发病高峰，在水稻分蘖高峰期出现第二个发病高峰，在水稻孕穗期出现第三个发痛高峰在前两个高峰期发病较严重带菌种子是水稻恶苗病的主要传染源，其次是病稻草，恶苗病病菌以分生孢子附着在种子表面或以菌丝体潜伏在种子内越冬播种病谷或用病稻草覆盖催芽，