转基因玉米EPSPS蛋白适体的筛选与结构分析

• 作 者: 江树勋 黄新 邵碧英 陈敏 陈洪俊 Jun Sheng Li
• 机 构: 福建出入境检验检疫局／福建省检验检疫技术研究重点实验室,中国检验检疫科学研究院,CentreforReproductionandGenomics,福建农林大学生命科学学院
• 出 处: 热带作物学报
• 发表日期: 2010年4期
• 关键词: 转基因玉米 EPSPS蛋白 SELEX 适体 结构 Genetically modified maize EPSPS protein SELEX Aptamer
• 基金项目: 科技部转基因生物新品种培育科技重大专项（No.2009ZX08012-001B）,中国检验检疫科学研究院基本科研业务费专项资金资助项目（No.2009JK001）,福建省科技攻关项目（No.2008Y0001）资助.

通过体外合成长度为70个碱基的随机ssDNA文库,采用指数富集配基的系统进化（SELEX）技术,以转基因玉米EPSPS蛋白为靶目标进行16轮筛选,将筛选到的适体群进行克隆、测序,初步获得与转基因玉米EPSPS蛋白特异性结合的适体。并用Macaw2.05和DNAMAN软件对每个适体的保守序列和二级结构进行分析。结果表明：一级结构分析序列同源性可分为四大群,其中A群有11条序列含有67个保守碱基;二级结构分析结果表明,茎环状和口袋状等结构可能是适体与转基因玉米EPSPS蛋白结合的结构基础。利用SELEX技术获