【摘 要】
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背景:肠道急性移植物抗宿主病是异基因造血干细胞移植后最常见的危及生命的并发症之一,由供体免疫活性T细胞攻击健康受体组织导致,目前治疗方案效果不佳.长链非编码RNA参与免疫反应等多种生物学过程,但在肠道急性移植物抗宿主病中的作用尚不清楚,有待进一步研究.目的:构建肠道急性移植物抗宿主病差异长链非编码RNA和mRNA表达谱,预测其可能的作用及机制.方法:采集4例单倍体造血干细胞移植后肠道急性移植物抗宿主病患者和4名健康志愿者的外周血单个核细胞进行高通量测序,并对差异mRNA进行GO和KEGG富集分析.根据基因
【机 构】
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山东中医药大学中医学院,山东省济南市 250014;山东中医药大学附属医院血液科,山东省济南市 250011
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背景:肠道急性移植物抗宿主病是异基因造血干细胞移植后最常见的危及生命的并发症之一,由供体免疫活性T细胞攻击健康受体组织导致,目前治疗方案效果不佳.长链非编码RNA参与免疫反应等多种生物学过程,但在肠道急性移植物抗宿主病中的作用尚不清楚,有待进一步研究.目的:构建肠道急性移植物抗宿主病差异长链非编码RNA和mRNA表达谱,预测其可能的作用及机制.方法:采集4例单倍体造血干细胞移植后肠道急性移植物抗宿主病患者和4名健康志愿者的外周血单个核细胞进行高通量测序,并对差异mRNA进行GO和KEGG富集分析.根据基因表达信号值的动态变化,构建差异长链非编码RNA-mRNA共表达网络,基于长链非编码RNA对下游靶基因不同的调节机制,分别预测其通过顺式或反式调控及经由竞争性内源RNA机制调控的靶基因,使用Cytoscape构建基因互作网络,通过对靶基因的功能分析预测差异长链非编码RNA可能的作用及相关机制.结果 与结论:肠道急性移植物抗宿主病患者的外周血单个核细胞中有1311个长链非编码RNA和3283个mRNA差异表达,GO和KEGG结果提示这些差异mRNA主要富集在白细胞介素18、白细胞介素1介导的信号通路、转录因子AP-1复合物、巨核细胞分化和肿瘤坏死因子信号通路,这与肠道炎性反应及与骨髓造血能力关系密切.差异长链非编码RNA顺式及反式调控的靶基因包括一些炎症相关分子,如ZEB2、CDK6、CEACAM1、CXCL1等,经由竞争性内源RNA机制调控的通路主要有PI3K/Akt通路和Notch通路,这与T细胞的活化以及肠道干细胞的稳态相关.结果 表明,差异长链非编码RNA可能通过调控炎症相关因子的表达,影响T细胞介导的免疫反应及肠道干细胞的稳态,在肠道急性移植物抗宿主病的发病及进展中发挥重要作用,可能成为诊断及治疗的新靶点.
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