【摘 要】
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海洋颗石藻病毒-宿主互作是影响海洋碳、硫生物地化循环及全球气候变化的重要环节.作为大的双链DNA病毒,颗石藻病毒进化出一种“病毒细胞代谢”模式,通过重编程宿主代谢途径以满足其代谢需求,但对这一代谢模式的调控机制尚缺乏足够的认识.MicroRNA(miRNA)作为一种基因表达调控的重要因子,能够通过调控代谢过程中的靶基因表达,从而调节相关代谢通路.本研究采用small RNA测序技术分析病毒感染颗石藻差异表达的miRNA及其靶基因功能,鉴定出26条成熟miRNA(包括2条病毒来源的miRNA),均来自23条
【机 构】
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集美大学食品与生物工程学院,厦门 361000
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海洋颗石藻病毒-宿主互作是影响海洋碳、硫生物地化循环及全球气候变化的重要环节.作为大的双链DNA病毒,颗石藻病毒进化出一种“病毒细胞代谢”模式,通过重编程宿主代谢途径以满足其代谢需求,但对这一代谢模式的调控机制尚缺乏足够的认识.MicroRNA(miRNA)作为一种基因表达调控的重要因子,能够通过调控代谢过程中的靶基因表达,从而调节相关代谢通路.本研究采用small RNA测序技术分析病毒感染颗石藻差异表达的miRNA及其靶基因功能,鉴定出26条成熟miRNA(包括2条病毒来源的miRNA),均来自23条新的miRNA前体序列,其中5条miRNA显著差异表达,包括4条上调,1条下调.实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证结果与miRNA-seq结果基本一致.功能富集分析显示,5个差异表达的miRNA可能参与调节糖代谢、脂代谢和氨基酸等代谢.此外,差异表达miRNA的表达水平与脂质代谢相关靶基因如ACC-1、SPT、ACOX、ACAT、CERS、ACADS等的表达水平呈负相关,说明这些miRNA可能在病毒感染过程中对宿主的脂质代谢发挥重要的调控作用.
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