【摘 要】
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目的建立日本血吸虫表达序列标签(SjEST)序列自动分析系统,筛选新基因、分析其表达谱.方法建立本地化日本血吸虫专业数据库,整合序列同源性比较软件(BLAST)及片段整合分析软
【机 构】
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广州市卫生局信息鉴定和评估中心,中山大学基础医学院寄生虫学教研室,中山大学基础医学院计算机中心
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目的建立日本血吸虫表达序列标签(SjEST)序列自动分析系统,筛选新基因、分析其表达谱.方法建立本地化日本血吸虫专业数据库,整合序列同源性比较软件(BLAST)及片段整合分析软件(PHRAP),运用生物信息学策略编写程序控制EST自动延伸.建立本地化蛋白库,对延伸结果进行蛋白库同源性分析.实现对成批数据大规模自动分析,筛选出可能的新基因全长cDNA序列,并进行基因表达谱分析.结果延伸系统规则有效,延伸结果序列与原始序列高度同源.对552条EST进行自动分析,487条得到不同程度的延长,其中有104条EST
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