GII.P7/GII.14型诺如病毒暴发的分子特征分析

• 作 者: 徐承 付建光 蒋翠莲 艾静 姚萍 鲍昌俊 朱叶飞
• 机 构: 210000 南京医科大学第二附属医院检验医学中心,江苏省疾病预防控制中心,南京市妇幼保健院,江苏省疾病预防控制中心,常州市疾病预防控制中心,江苏省疾病预防控制中心,210000 南京医科大学第二附属
• 出 处: 国际病毒学杂志
• 发表日期: 2017年24期
• 关键词: Norovirus Outbreak Genotype recombination

目的

了解江苏地区3起诺如病毒（Norovirus，NoV）暴发疫情中病毒感染情况，并对其分子流行病学特征进行初步研究。

方法

收集暴发疫情中患者的肛拭子标本53份，采用实时荧光RT-PCR定性检测NoV，阳性标本利用普通RT-PCR对其聚合酶区（RNA-dependent RNA polymerase，RdRp）及衣壳蛋白区（VP1 ）片段进行扩增和测序分析。

结果

3起NoV暴发疫情中，阳性检出率为56.6% （30/53 ）。对30株阳性标本序列进行分析，其RdRp区与GII.P7的同源性最高（93.86%），VP1区与GII.14的同源性较高（97.13%）。初步判断为GII.P7/GII.14重组毒株，SimPlot分析可能的重组位点在核苷酸5 009位。对其氨基酸序列进行分析发现在RdRp区和VP1区均出现部分氨基酸突变。

结论

3起NoV暴发疫情均由同一重组毒株引起，提示GII.P7/GII.14重组株传染性较强，有可能再次引起暴发，应加强监测防控。