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番茄红素对光、热、氧化剂、高价金属离子等在食品加工保藏和番茄红素提取过程中常见的环境因素很不稳定，光照会导致番茄红素分解，加热可能会导致番茄红素从反构向顺构转变；光照、加热和金属离子等因素会促进番茄红素的氧化分解；还原剂如BHT和Vc可延缓番茄红素的氧化；处于番茄原果和有机溶剂中的番茄红素比较稳定，而分离的纯番茄红素易发生变化。