【摘 要】
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目的探讨环状RNA(circularRNA,circRNA)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)癌组织及对应癌旁组织中表达谱的变化,并分析二者的差异。方法应用高通量circRNA芯
【机 构】
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首都医科大学附属北京安贞医院胸外科,首都医科大学附属北京安贞医院检验科
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(81500332);北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养项目(2015-3-052)
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目的探讨环状RNA(circularRNA,circRNA)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)癌组织及对应癌旁组织中表达谱的变化,并分析二者的差异。方法应用高通量circRNA芯片技术筛选3例患者NSCLC癌组织及对应癌旁组织中circRNA表达谱的差异,经过对原始数据进行预处理、归一化后,筛选出差异表达的circRNA,并对其进行聚类分析和生物信息学预测。结果芯片检测结果显示circRNA在以上组织标本中表达分布几乎是相同的;层次聚类分析、散点图和火山图结果显示差异表达的circRNA能将NSCLC癌组织与癌旁组织明显区分开来。NSCLC癌组织与癌旁组织之间存在171种circRNA的差异表达,其中在肿瘤组织中高表达的有148种,低表达的有23种(变化>2倍且P<0.05)。应用Target Scan和miRanda软件预测出每种差异circRNA结合匹配值较高的5个微小RNA(microRNA,miRNA),提示包括miR-21、miR-22、miR-29、miR-129、miR-143、miR-150和miR-200等均为在NSCLC发生发展中起着重要调控作用的miRNA。结论 NSCLC癌组织与对应癌旁组织比较,circRNA表达谱发生了显著变化,这些差异表达的circRNA可能与非小细胞肺癌的发生发展密切相关。
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