【摘 要】
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目的 构建人类血液中环状RNA(circRNA)及mRNA的表达谱,分析血液中与衰老相关的差异表达的circRNA,预测其潜在生物学功能和通路.方法 对2017年5月在首都医科大学附属北京安贞
【机 构】
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首都医科大学附属北京安贞医院心内科北京市心肺血管疾病研究所 100029
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目的 构建人类血液中环状RNA(circRNA)及mRNA的表达谱,分析血液中与衰老相关的差异表达的circRNA,预测其潜在生物学功能和通路.方法 对2017年5月在首都医科大学附属北京安贞医院招募的19对祖孙(老年组和青年组)的38份血液样本进行circRNA/mRNA基因微阵列分析,筛选老年组和青年组血液标本中差异表达的circRNA/mRNA,运用基因本体论和KEGG技术分析这些circRNA涉及的生物学过程和相关信号通路,并依据ceRNA理论构建circRNA-微小RNA-mRNA网络.结果 通过构建的表达谱分析比较老年组和青年组血液中circRNA的表达水平,发现了648个差异性表达的circRNA(141个circRNA上调,507个circRNA下调),959个差异表达的mRNA(230个mRNA上调,729个mRNA下调),基因本体论和KEGG分析表明,这些circRNA可能涉及JNK调节途径、细胞周期相关途径、凋亡细胞清除途径等生物学过程和癌症、碱基切除修复等相关信号通路.共筛选出89个circRNA,6个微小RNA以及59个mRNA成功构建ceRNA调控网络.结论 基因微阵列分析人类血液中circRNA的表达谱,可对其进行潜在功能及通路的预测和分析,本研究可为未来circRNA和衰老的相关研究提供新靶点.
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