【摘 要】
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目的 分析2010年宁夏回族自治区流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)VP1基因特征.方法 用特异引物通过逆转录聚合酶链反应(reverse transcriptase polymerase chain reaction,RT-PCR),对2010年分离自宁夏手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)病例的CA16毒株,进行
【机 构】
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102206北京,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所卫生部医学病毒学和病毒病重点实验室,宁夏自治区疾病预防控制中心,宁夏自治区疾病预防控制中心,102206北京,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
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目的 分析2010年宁夏回族自治区流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)VP1基因特征.方法 用特异引物通过逆转录聚合酶链反应(reverse transcriptase polymerase chain reaction,RT-PCR),对2010年分离自宁夏手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)病例的CA16毒株,进行VP1编码基因的扩增.扩增阳性产物进行序列测定,采用生物信息学软件进行分析.结果 本研究共获得62株CA16的VP1编码序列,其核苷酸和氨基酸序列同源性分别为90.1％ ～100％(平均94.5％)和98.7％ ～100％(平均99.6％).在亲缘性关系树上与B1基因亚型毒株位于相同分支,且各个地市流行株又同时存在B1a和B1b分支.结论 与全国流行情况相一致,宁夏2010年存在B1a和B1b分支CA16的共循环,毒株间具有较大的核苷酸序列差异,提示流行中存在多个传播链。
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