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国家政策提倡“科技强国”，通过给予科技事业扶持、经费支持及税收优惠等措施，鼓励科技事业发展。但在实际执行过程中，部分企业因为不熟悉流程、缺乏相关经验以及在项目中忽视财务的重要性等，在科研经费的申报时，遭遇困难。本文在分析企业项目研发财务问题产生的具体原因以及研发支出项目的关注点的基础上，给出制定研发支出核算管理办法的建议：（1）设置完整的项目账套；（2）财务部门全程参与项目研发过程；（3）建立研发支出使用独立审批权限制度；（4）财务人员实时跟踪经费使用情况，并按期向项目负责人进行汇报，形成项目研发期间报告；（5）项目完成验收应做的准备工作；（6）项目资料的归集。本文期望通过提出相关建议，帮助企业在实施研发项目时，建立自身的研发支出管理制度、权限管理办法以及独立的核算体系，从而有利于企业优化申报研发项目经费和税收优惠流程。