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以3个矮生南瓜自交系和2个蔓生南瓜自交系为试材，利用Primer5软件开发南瓜植物中具有特异性的SSR引物，并通过正交实验和梯度PCR试验对影响南瓜SSR-PCR结果的主要条件进行优化筛选，以期建立最佳的SSR—PCR反应体系。结果表明：20弘L反应体系含有1．5mmol／L M^2＋,60ngDNA，0．20mmol／L dNTPs，0．25mmol／L Primer和1．5UTaq酶，最佳退火温度为44．1℃。