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清末传统学术研究机构被废弃后，新学制中相继有大学院、通儒院、学士院等国家级学术机构之设计，但真正对设立国家研究院作详细规划并力谋付诸实施者，乃为马相伯之“函夏考文苑”设想。在民初新学制之外，马相伯效仿法兰西学院模式，设计了一套集中型学术研究体制，力谋创建独立的国家学术研究院。“函夏考文苑”之“学术独立”原则，为中央研究院所继承；其拟设之主要研究机构，后来亦在中央研究院中得到某种程度的体现。一在地质调查所、中国科学社生物研究所之示范作用下，20世纪20年代中期以后全国兴起了创建学术研究机构之热潮。独立的专业