成人视网膜假定蛋白基因ARHP的克隆及生物信息学分析

• 作 者: 李峰 蒋卫红 尹志华 杨旭宇 冯湘玲 刘卫东 姚开泰
• 机 构: 中南大学湘雅医学院肿瘤研究所,中南大学湘雅医院耳鼻喉科
• 出 处: 生物化学与生物物理进展
• 发表日期: 2003年6期
• 关键词: 成人视网膜假定蛋白基因 基因克隆 生物信息学分析 表达序列标签 ARHP cloning bioinformatics analysis
• 基金项目: 国家重点基础研究发展规划项目( 973) (G1 9980 51 2 0 0 )~~

从UniGene库中选取编号为BG222624来自人鼻咽组织的表达序列标签(EST)序列，联网到NCBI调用Blast服务器分析，发现该EST序列是一个代表新基因的未知序列，利用Blast检索GenBank的nr数据库和EST数据库，构建EST重叠群，联网到NCBI的ORF finder服务器，分析发现该EST重叠群具有完整的阅读框架。分别在cDNA序列阅读框架的起始密码子和终止密码子的两侧设计引物，以人胎脑cDNA文库为模板，进行PCR扩增，测序确定该基因的cDNA全长序列．该基因cDNA序列全长为l6