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2007年5月29日突然暴发的太湖蓝藻事件使蓝藻成为人们关注的焦点，之后，全国各地均有蓝藻暴发的报道。暴发的蓝藻一方面大量消耗水中的溶解氧，另一方面厚厚的蓝藻形成层如同油漆，阻隔了空气与水中气体的交换，使水体的溶解氧浓度迅速降低，造成鱼虾、螺蛳等水生生物的大量死亡，导致水体遭受严重污染；有些蓝藻的代谢物以及死亡的生物被细菌分解过程中会产生一些毒素，这样的水体进一步使鱼卵变异及生长异常。家畜及野生动物饮用了含毒素的水后，会出现腹泻、乏力、厌食、呕吐、嗜睡、口眼分泌物增多等症状，甚至死亡。