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目的：探讨分析应用奥美拉唑联合莫沙必利治疗反流性食管炎的临床疗效。方法：选取2012年12月～2013年12月间我院收治的84例反流性食管炎患者作为研究对象，将其随机分为对照组（42例）和观察组（42例），应用奥美拉唑为对照组患者进行治疗，应用奥美拉唑联合莫沙必利为观察组患者进行治疗，观察对比两组患者的临床疗效，并将对比的结果及两组患者的临床资料进行回顾性的分析。结果：观察组患者治疗的总有效率为95.2%，对照组患者治疗的总有效率为69.0%，观察组患者的临床疗效明显优于对照组患者，差异显著（P＜0.05），具有统计学意义。观察组患者的不良反应发生率为2.4%，对照组患者的不良反应发生率为7.1%，观察组患者的不良反应发生率明显低于对照组患者，差异显著（P＜0.05），具有统计学意义。结论：应用奥美拉唑联合莫沙必利治疗反流性食管炎的临床疗效显著，不良反应的发生率较低，安全可靠，值得在临床上推广应用。