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木霉对棉花枯萎病菌(Fusarium oxysporum f. sp.Vasinfectum)的幼菌丝具有强烈的寄生能力,对于老熟菌丝的寄生能力较弱.木霉能够产生琼脂扩散性和挥发性抑菌物质,绿色木霉LTR-2产生的挥发性抑菌物质能强烈抑制棉花枯萎病菌的菌丝生长.木霉生物防治作用的另外一种方式是与病原菌竞争营养物质,研究发现葡萄糖是竞争对象之一.木霉具有很强的β-1,3-葡聚糖酶和几丁质酶活性.培养液中添加几丁质、木霉菌或者棉花枯萎病菌菌丝干粉后培养木霉,培养液上清能够破坏枯萎病菌的菌丝尖端并导致原生质体的泄露,该现象主要与木霉的几丁质酶活性有关.木霉对棉花黄萎病菌具有相同的作用方式.