鸡热休克蛋白70基因克隆、单核苷酸多态性检测及生物信息学分析

• 作 者: 晁哲 林哲敏 刘海隆 张星 郑心力 黄丽丽 谢亮 王峰
• 机 构: 海南省农业科学院畜牧兽医研究所,海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室
• 出 处: 中国畜牧兽医
• 发表日期: 2014年3期
• 关键词: 鸡 热休克蛋白70基因 多态性 生物信息学分析 chicken HSP70 gene polymorphism bioinformatics analys
• 基金项目: 海南省自然科学基金项目（311043、313099）,海南省科学事业费项目（琼财预[2013]131号）,现代农业产业技术体系专项资金项目（CARS-42）.

试验旨在克隆鸡热休克蛋白70（heatshockprotein70，HSP70）基因，获得基因序列并分析基因结构和相关遗传变异，检测单核苷酸多态性（SNP）位点在文昌鸡和北京油鸡群体中的分布。试验利用PCR扩增鸡HSP70基因组序列，通过克隆测序寻找基因中的突变位点。在鸡HSP70基因组中共发现3处突变位点，分别位于启动子区（T-564C）、5’非翻译区（A68G）和编码区（A-1044G）。使用PCR—RFLP方法检测T564C位点后发现，等位基因C在文昌鸡和北京油鸡中的基因频率分别为0．87和0．55