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在“2011计划”思想的指导下，一批以高等院校牵头，联合科研院所、生产企业的高校协同创新中心不断发展的同时也产生了许多问题。传统的绝对考评评价模式不能满足高校协同创新中心构成复杂、利益诉求不同以及奖惩不统一等问题。为了解决高校协同创新中心的实际问题，本文提出了相对考评的考核评价模式，在了解和满足构成高校协同创新中心不同组织不同利益诉求的基础上进行考核评价，以求达到高校协同创新中心的内部和谐发展。