基于iTRAQ技术的肝癌细胞蛋白质组学研究

• 作 者: 关媛月 高玉雪 庄园 陈德喜 王延军
• 机 构: 首都医科大学附属北京佑安医院北京市肝病研究所
• 出 处: 中国医药导报
• 发表日期: 2021年15期
• 关键词: 乙型肝炎病毒 肝癌细胞 蛋白质谱分析 差异蛋白
• 基金项目: 国家自然科学基金资助项目(82073676),北京市自然科学基金资助北京市教育委员会科技计划重点项目(KZ202010025037),新型冠状病毒中德合作研究应急专项项目(C-0012),北京市肝病研究所所内基金课题(Y-2020TD-6),王宝恩肝纤维化研究基金项目(WBE2021052)。

目的利用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术筛选稳定表达乙型肝炎病毒(HBV)的HepG2.2.15细胞与其亲本HepG2细胞差异表达的蛋白。方法使用iTRAQ技术对HepG2.2.15细胞和HepG2细胞中的差异蛋白进行分析,并借助生物信息学对差异蛋白进行功能聚类和信号通路分析。以两组间细胞差异倍数(FC)≥1.2及P<0.05为标准筛选差异蛋白。应用基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)等分析软件对差异蛋白进行生物信息学分析。结果本研究共筛选出856个差异表达蛋白,其中上