两种HIV-1基因型耐药检测方法用于干血斑样本的比较

来源 :中国热带医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kyuiyigjghj
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的使用两种HIV-1基因型耐药检测方法分别检测干血斑(Dried Blood spot,DBS)样本并比较耐药结果,以期建立适合的检测方法。方法选择河南省和安徽省经高效抗逆转录病毒治疗(highly active anti-retroviral therapy,HAART)5年以上HIV感染者共35名,采集全血制作干血斑标本,进行CD4+细胞计数和病毒载量测定,分别使用两种文献报道的方法扩增干血斑标本中的HIV-1 pol区核苷酸片段,进行HIV-1基因型耐药检测,并比较34个主要耐药突变位点差异。结果低载量<1×103copies/m L,方法2具有更高的扩增率(5/5),而方法1能扩增成功3份(3/5)。方法2共检出269个主要耐药突变位点,两种方法耐药位点的一致率为95.9%(258/269)。与方法1比较,有11个耐药位点存在差异,7个位点由混合碱基引起,另4个差异位点则集中为:E138Q和K101Q。结论两种方法都能够检测病毒载量大于1×103copies/m L的样本,但是对于低载量样本方法 2较方法 1有更好的表现,后续应选择更多的不同亚型标本进行研究。 Objective To detect two samples of DRS (resistant blood spot, DBS) and compare drug resistance with two HIV-1 genotypic drug resistance test methods in order to establish a suitable detection method. Methods Thirty-five HIV-positive patients with highly active anti-retroviral therapy (HAART) in Henan and Anhui Provinces were collected. Whole blood was collected to make dry blood spot samples for CD4 + cell count and viral load Two kinds of reported methods were used to amplify nucleotide fragments of HIV-1 pol in the dried blood spot samples, and the HIV-1 genotypes were tested for drug resistance. The difference of 34 major drug-resistant mutation sites was compared . Results Low loading <1 × 103 copies / m L, method 2 had a higher rate of amplification (5/5), and method 1 successfully amplified 3 (3/5). Twenty-two out of 269 major resistance mutations were detected in method 2, and the agreement between the two methods was 95.9% (258/269). Compared with the method 1, there are 11 resistance sites there are differences, seven sites caused by the mixed base, the other four differences are concentrated at: E138Q and K101Q. Conclusions Both methods are capable of detecting samples with a viral load greater than 1 × 10 3 copies / m L but perform better with method 1 for low-load samples and more subtypes later.
其他文献
随着教育改革的不断推进,基于素养教育的教学活动已成为目前课程教学中的热点.立足于此,首先概述了素养教育的内涵,然后就如何在目前的农村中学美术教学中培养学生的素养教育
期刊
期刊
期刊
基于新华医院总平面布局现状,为最有效地组织新建病房楼、医技楼与已建门诊病房楼及内科病房楼等建筑物之间的各种流线关系,及各主要建筑间的总体外部空间关系,从建筑布局上
目的了解白沙县全球基金疟疾项目实施结果,为当前消除疟疾工作提供重要科学的参考价值。方法收集全县14个卫生院、9个农场项目执行单位、通过开展大量的疟疾诊断、治疗、预防
期刊
@@
矿用一般型高压开关柜主要用在煤矿井下中央配电室,是矿井供电的枢纽部位,担负着为全矿的采掘生产、通风、运输、排水及照明等提供可靠的电力供电的重大责任,中央变电所开关柜的
水力压裂长期以来都是我国石油行业当中,低渗透油藏提高产量的关键措施,最近几年以来还在煤层气研发中得以应用.伴随着压裂地层深度与温度的提升,石油压裂液体出现类型较多、
期刊