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在归纳和总结国内外关于区域创新体系（RIS）最新研究成果的基础上,构建了以研发投入、经济结构、基础设施、人力资本、对外开放程度和创新政策六大因素为基础的RIS影响因素分析模型。以深圳1998—2009年度的创新活动数据为样本,采用主成分回归方法分析了RIS六大影响因素对创新产出的影响程度及作用。结果表明上述六大影响因素均与深圳RIS创新产出正相关。鉴于深圳是我国目前第一个国家创新型城市试点,该实证分析结果对我国目前广泛兴起的RIS构建研究提供了重要的参考和借鉴。