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随着生物技术和荧光标示技术的飞速发展，3H0吲哚菁染料已成为在DNA，蛋白质及核酸等分析检测中使用的主要荧光探针。其中代表性化合物Cy3.、Cy5.作为新一代商品化荧光标示剂在生物芯片、分子信标等方面得到了重要应用。本文综述了该类碳菁染料在生物领域中取得的重大应用进展，并探讨了其结构与性能之间的关系。