两株2．1d新基因亚型猪瘟病毒的全基因组序列分析及其基因亚型分子特征

• 作 者: 冯丽苹 张洪亮 彭金美 刘春晓 王倩 李真 吴桐 翁长江 蔡
• 机 构: 长江大学生命科学学院,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
• 出 处: 中国预防兽医学报
• 发表日期: 2016年1期
• 关键词: 猪瘟病毒 2.1d亚型 分子特征 classical swine fever virus 2. ld new subgenotype genome charac
• 基金项目: 国家自然科学基金（31001050/C1803）

为研究猪瘟病毒（CSFV）2．1d新基因亚型的基因组特征，本研究根据GenBank中登录的zj0801株CSFV全基因组序列设计合成6对引物，通过RT-PCR方法对2014年分离自山东的两株2．1d亚型CSFV（SDSGl410和SDLSl410）进行全基因组测序，两株CSFV全长均为12296nt。全基因组遗传演化分析表明这两个分离株位于一个独立分支中，属于2．1d亚型，与E2基因分型结果一致。核苷酸和推导氨基酸同源性分析显示，分离株全基因组同源性与参考株相比差异较大，与zi0801株的全基因组同源性最