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随着我国社会经济的迅猛发展，我国的科学技术取得了很大的进展，而计算机网络的应用使得人们的生活越来越便捷，计算机网络的利用在人们的生活和工作当中可以说是无处不在，而在医院的财务管理当中，对于计算机的利用也越来越多，所以医院的计算机管理的安全问题就成了一个十分重要的问题，只有保障了医院财务管理系统的安全，才能够保障医院的整个体系能够良好的运作。本文对于医院当中的计算机财务管理系统当中的运作进行财务系统的流程分析，对于提高医院计算机财务管理系统的安全性总结了相关措施，对于我国医院的财务管理具有十分积极的意义。