基于EST数据的柞蚕SSR标记开发

• 作 者: 郑茜茜 马红方 谌苗苗 钟亮 李群 王欢 夏润玺 李喜升 王凤成
• 机 构: 沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳,110866;沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳110866;辽宁省蚕业科学研究所,辽宁凤城118100;辽宁省蚕业科学研究所,辽宁凤城,118100
• 出 处: 蚕业科学
• 发表日期: 2016年1期
• 关键词: Antheraea pernyi Expressed sequence tag (EST) Simple sequence repeat (SSR)

柞蚕SSR标记的开发对研究柞蚕的遗传与进化、分子遗传图谱构建、功能基因定位和克隆等有重要意义.从1 500条柞蚕表达序列标签(EST)中鉴定了71个SSR位点,平均5.2 kb出现1个SSR位点,在1～6个碱基的重复基元中,以3个和4个核苷酸重复为主导类型.设计合成了29对EST-SSR引物,通过PCR扩增和电泳检测鉴定了7对具有多态性的引物,测序验证结果表明其中的4对为有应用价值的EST-SSR标记.建立的利用EST数据开发柞蚕SSR标记的方法,有助于进一步大量开发柞蚕SSR分子标记.