基于转录组测序筛选鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失菌的差异表达基因

• 作 者: 杨阳 杨琦 董然然 潘永 李晨 刘丽娟 文明
• 机 构: 贵州大学动物科学学院,贵州大学动物疫病研究所,贵州省动物疫病研究室,贵州省畜禽资源遗传管理站,贵州都匀市动物疫病预防控制中心
• 出 处: 畜牧兽医学报
• 发表日期: 2019年12期
• 关键词: 沙门菌 沙门菌hfq基因缺失株 sRNA伴侣蛋白Hfq
• 基金项目: 国家自然科学基金(31602065);贵州省科学技术基金(科合LH字[2017]7263;黔科合平台人才[2017]5788;黔科合基础黔科合基础[2016]1047);贵州大学博士基金项目(贵大人基合字(2015)61号)

旨在鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株转录组测序中分析适应环境变化及细菌分泌通路,筛选相关基因。通过使用实时荧光定量PCR对鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株转录组测序结果进行验证,从而对鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失株的细菌趋化性通路、细菌双组分通路、细菌分泌通路进行深入分析,筛选相关的重要调控基因。结果显示:在细菌趋化性通路中筛选出yiaD、STM 3138、STM 3216和malE等4个共表达基因;在细菌分泌通路中筛选出spaP、invA、prgH、invE、spaS、invG和ssaV等7个共表达基因;在细菌双