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考虑到资料可获取性和指标的适用性以及新疆沙漠化的具体特点，新疆沙漠化防治区划工作在第三级区划中设计和采用了沙尘天气指数、土地覆被指数、植被盖度指数、大风指数和海拔高程指数作为区划主体指标，同时还采用了自然地理单元、县级行政区划界线、雨养植被界线、耕居地人口密度、人口耕居地比例作为辅助指标。最后，把由主体指标经指数和法合成的沙漠化综合评级指数作为最主要依据，划定三级区划界线。