泡桐丛枝植原体河北平山和江西吉安株系胸苷酸激酶基因多态性分析

• 作 者: 宋传生 胡佳续 林彩丽 任争光 耿显胜 田国忠
• 机 构: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室,天津出入境检验检疫局,中国林业科学研究院亚热带林业研究所
• 出 处: 林业科学
• 发表日期: 2014年8期
• 关键词: 泡桐丛枝植原体 胸苷酸激酶基因 假基因 功能域 变异 系统进化 paulownia witches ’-broom phytoplasmathymidylate

设计引物并 PCR扩增河北平山株系 PaWBPs 和江西吉安株系 PaWBJan 的 tmk 基因，直接和克隆测定tmk序列，利用DNAMAN，MEGA等软件进行序列多样性、序列变异、蛋白功能域、系统进化等比较分析。结果表明：从 PaWBPs和 PaWBJan中克隆测序的93条和41条 tmk-a中，分别有52和24种不同的序列，tmk-a ORF 可被划分为2类，tmk-a-1为639 bp，tmk-a-2为627 bp，PaWBPs株系tmk-a-1与tmk-a-2序列条数的比值约为2.5，而PaWB