马铃薯StCDPKs基因家族成员鉴定与表达分析

• 作 者: 洪旭升 李世贵 杨江伟 罗红玉 张宁 司怀军
• 机 构: 甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃农业大学农学院,甘肃省干旱生境作物学省部共建国家重点实验室培育基地
• 出 处: 甘肃农业大学学报
• 发表日期: 2020年5期
• 关键词: 马铃薯 StCDPK基因 基因鉴定 盐胁迫 表达分析 potatoStCDPKsgenetic identificationsalt stressexpress
• 基金项目: 国家自然科学基金项目(31660416),甘肃省现代农业马铃薯产业技术体系项目(GARS-03-P1).

【目的】通过对马铃薯StCDPKs基因家族成员的鉴定与表达模式分析,初步阐明该基因家族在马铃薯胁迫响应中的功能.【方法】用隐马尔科夫模型鉴定马铃薯StCDPKs基因家族成员,MEGA6.0构建StCDPKs蛋白序列的系统进化树,qRT-PCR分析StCDPKs基因在组织特异性和盐胁迫下的表达情况.【结果】本研究共鉴定出27个马铃薯StCDPKs基因家族成员,它们均包含CDPKs蛋白钙离子结合域最保守的结构域EF-hand;其中StCDPK2/421/22/25基因在马铃薯不同组织中表达差异显著,StCDP