鸡Lpin1基因3′-UTR遗传变异及其对miRNA结合位点的潜在效应

• 作 者: 李素雅 张建宏 陈文 黄艳群 孙桂荣 韩瑞丽 康相涛
• 机 构: 河南农业大学生命科学学院,河南农业大学牧医工程学院／家禽种质资源创新工程中心
• 出 处: 中国农业科学
• 发表日期: 2012年8期
• 关键词: 鸡 Lpin1基因 3′-UTR 遗传变异 miRNA靶位点 chicken Lpin1 gene 3′-UTR genetic variation m
• 基金项目: 国家自然科学基金（30771533）, 郑州市创新型科技人才队伍建设工程科技创新（096SYJH16092）, 家养动物种质资源平台

【目的】研究鸡Lpin1基因3′-UTR遗传变异/单倍型及其在品种间的分布,并预测这些变异对miRNA结合位点的潜在效应。【方法】根据鸡Lpin1基因组序列（GenBank登录号：NC_006090）设计一对特异性引物,采用PCR直接测序结合克隆测序的方法,进行鸡Lpin1基因3′-UTR及其邻近外显子在品种间的遗传变异/单倍型分析【。结果】①从6个品种中发现了8个变异位点,包含两个插入/缺失变异。这些变异均位于鸡Lpin1基因的3′-UTR,3′-UTR的变异频率为17SNPs/kb;②在鸡Lpin1基