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目前在开展住院医师培训工作中，存在着几个需要进一步探讨的问题：（1）住院医师培训与培养主治医师的概念相混淆。住院医师培训是毕业后教育的组成部分，主治医师等职务的培训属岗位培训或岗前培训，应另立计划；（2）培训内容笼统、抽象。应将可量化的诊疗技术及手术操作等内容，划分成不同的等级，以便于在各培训阶段具体掌握；（3）培训过程缺乏约束机制。应制定住院医师培训质量评估方案，建立评估指标体系，以促进培训工作的深入、持续发展；（4）在住院医师培训与研究生培养的结合上存在困难。应将两者均纳入住院医师培训的体制中去，采用“一体两轨制”的设想。此外，应尽早建立医学专业学位制度，以有利于解决两者在培训中的矛盾，有利于稳定住院医师队伍。