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蛋白质序列的一种新的三维图形表示及其应用
蛋白质序列的一种新的三维图形表示及其应用
来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yanzi774
【摘 要】
:
基于氨基酸的五字母模型,给出蛋白质序列的一种新的三维图形表示,然后构造一个12维向量来刻画蛋白质序列,这个向量的分量是与12个图形相对应的D/D矩阵的正规化的ALE-指标。最后基
【作 者】
:
李丹丹
王俊
李春
【机 构】
:
渤海大学数学系
【出 处】
:
生物信息学
【发表日期】
:
2009年1期
【关键词】
:
蛋白质序列
图形表示
ALE-指标
冠状病毒
系统发生
Protein sequence
Graphical representation
ALE - i
【基金项目】
:
辽宁省教育厅科学研究计划(2006(018),渤海大学博士基金(KJ013).
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基于氨基酸的五字母模型,给出蛋白质序列的一种新的三维图形表示,然后构造一个12维向量来刻画蛋白质序列,这个向量的分量是与12个图形相对应的D/D矩阵的正规化的ALE-指标。最后基于s结构蛋白对冠状病毒进行系统发生分析来阐明该方法的有用性。
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