【摘 要】
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目的 采用生物信息学方法进一步筛选和验证胰腺癌血浆标志物,为明确其分子机制提供依据.方法 通过关键词“胰腺癌、血浆、miRNA”进行检索,搜集文献,并下载原始数据,进行生物信息学分析,寻找具有特异性的血浆miRNA标志物,预测其靶基因,进行通路富集和互作分析,通过文献数据和数据库进行关键基因的验证,分析其差异表达谱及其与胰腺癌预后的关系.结果 通过对GSE59856和GSE124158进行差异miRNA的筛选,最后筛选得出miR-122-5 p.通过对miR-122-5 p预测得到了517个靶基因,并对靶
【机 构】
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重庆医科大学附属第一医院临床分子医学检测中心,重庆 400042;重庆医科大学生命科学院,重庆 400042;陆军军医大学第一附属医院检验科,重庆 400038
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目的 采用生物信息学方法进一步筛选和验证胰腺癌血浆标志物,为明确其分子机制提供依据.方法 通过关键词“胰腺癌、血浆、miRNA”进行检索,搜集文献,并下载原始数据,进行生物信息学分析,寻找具有特异性的血浆miRNA标志物,预测其靶基因,进行通路富集和互作分析,通过文献数据和数据库进行关键基因的验证,分析其差异表达谱及其与胰腺癌预后的关系.结果 通过对GSE59856和GSE124158进行差异miRNA的筛选,最后筛选得出miR-122-5 p.通过对miR-122-5 p预测得到了517个靶基因,并对靶基因作GO/KEGG富集分析.进一步对靶基因做蛋白互作图,并通过相关文献的查询与筛查,筛选出UBA52、AD-AM10、CBL、VAMP3这4个关键基因.根据TCGA表达谱及文献数据论证,与健康人相比,胰腺癌患者高表达UBA52、ADAM10、CBL、VAMP3.VAMP3、ADAM10基因低表达的胰腺癌患者总体生存率更高(P<0.05).结论 采用生物信息学方法对胰腺癌患者血浆差异miRNA进行分析,筛选出的miR-122-5 p具有作为胰腺癌诊断标志物的潜力.miR-122-5p作用的关键靶基因VAMP3、ADAM10与胰腺癌的预后密切相关.
其他文献
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目的 初步建立深圳市罗湖区孕妇不同孕期D-二聚体(D-D)、纤维蛋白降解产物(FDP)的参考区间,并探讨动态检测D-D、FDP对产后出血的早期预测价值.方法 选取2018年8月至2020年12月就诊于深圳市罗湖区妇幼保健院和深圳市罗湖区人民医院做产前检查的健康单胎妊娠妇女1138例作为健康妊娠组,健康孕妇按孕周分为早孕期(28周)401例.选取同期在深圳市罗湖区妇幼保健院体检的300例健康非孕妇女作为健康对照组.产后出血组:凝血异常的产后出血84例.采用免疫比浊法检测D-D、FDP的水平.用P 95表示D
目的 评估载脂蛋白(a)基因(LPA)在肝细胞癌(HCC)组织中差异表达特征,确定LPA对HCC发生和预后的影响.方法 根据现有肿瘤基因组图谱计划(TCGA)和基因型组织表达(GTEx)正常组织数据库,获取369例肝癌组织标本和159例癌旁正常组织标本.借助基因表达谱交互分析(GEPIA)平台探讨33种癌症组织中LPA mRNA的差异,分析LPA对HCC患者肿瘤分级和总生存期(OS)中的影响;采用Pearson相关系数法,分别分析LPA mRNA(LPA-001)与DNA错配修复基因(MLH1、MSH2、
目的 研究生长抑素联合前列地尔治疗老年脓毒症胃肠功能障碍的临床效果及对血清肠型脂肪酸结合蛋白(I-FABP)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)水平的影响.方法 采取前瞻性研究的方法,以该院2018年6月至2020年5月收治的124例脓毒症胃肠功能障碍老年患者作为研究对象,将患者随机分为观察组和对照组,每组62例,两组患者均采取生长抑素治疗,观察组患者在此基础上联合采用前列地尔治疗,两组患者均治疗7 d.比较两组患者的APACHEⅡ评分、SOFA评分、胃肠功能、炎性指标、不良反应以及血清I-FABP、GS
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Duffy血型系统是继 ABO 血型之后第 8 个被国际输血协会(ISBT)确认的血型系统[1].该血型系统主要涉及Fya 和Fyb 抗原,其对应的抗体大多是通过输血或妊娠免疫产生的IgG类抗体,“天然抗体”很少见.此类抗体可引起新生儿溶血性疾病(HDN)、急性或迟发性溶血性输血反应,具有重要的临床意义[2-3].笔者发现 1 例少见的抗 Fya 抗体引起交叉配血不合的病例,现报道如下.
目的:探讨颈项透明层(nuchal translucency,NT)增厚与高龄孕妇妊娠结局与胎儿结构畸形和染色体核型异常的相关性.方法:回顾性分析2017年至2020年在南京医科大学附属第一医院行NT检查的279例(实访)孕妇围产期的人口学特征、胎儿畸形的发生率、畸形类型、染色体核型结果以及妊娠结局等临床资料,比较高龄和正常龄孕妇妊娠结局中胎儿结构畸形、染色体核型异常与胎儿NT增厚相关性.结果:以NT值2.5 mm为界,结果显示NT正常的孕妇,高龄组97例,结局顺利80例,结局不顺利17例,胎儿结构畸形2
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