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目的:通过分析2011-2012年从阜阳市手足口病患儿中分离到的柯萨奇病毒A10型(CoxA10)的VP4区的基因特征,了解该病毒的变异情况。
方法:采集阜阳市手足口病患儿的咽试子标本,提取病毒的RNA后,用肠道病毒VP4区分型引物进行半巢式RT-PCR,通过测序和GenBank Blast比对,从而确定肠道病毒的型别,并对其VP4区进行序列和进化分析。
结果:鉴定出3株CoxA10,在VP4区核苷酸序列同源性为95%~99%,3株CoxA10病毒与GenBank中的参考毒株VP4区核苷酸序列同源性为77%~97%。其中,与中国株HQOO5431的同源性为96%~97%,与日本株AB282808同源性为85%~86%,与CoxA10原型株Kow alik(AF081300)的同源性为77%~78%,进化分析表明,这三株分离株与CVA10原型株Kowalik株聚成一簇,分子定型的结果显示,这三株病毒全部属于CVA10。
结论:2011-2012年阜阳地区手足口病病原体CVA10的VP4中国株HQOO5431在进化上密切相关,其序列未发生明显变异。
方法:采集阜阳市手足口病患儿的咽试子标本,提取病毒的RNA后,用肠道病毒VP4区分型引物进行半巢式RT-PCR,通过测序和GenBank Blast比对,从而确定肠道病毒的型别,并对其VP4区进行序列和进化分析。
结果:鉴定出3株CoxA10,在VP4区核苷酸序列同源性为95%~99%,3株CoxA10病毒与GenBank中的参考毒株VP4区核苷酸序列同源性为77%~97%。其中,与中国株HQOO5431的同源性为96%~97%,与日本株AB282808同源性为85%~86%,与CoxA10原型株Kow alik(AF081300)的同源性为77%~78%,进化分析表明,这三株分离株与CVA10原型株Kowalik株聚成一簇,分子定型的结果显示,这三株病毒全部属于CVA10。
结论:2011-2012年阜阳地区手足口病病原体CVA10的VP4中国株HQOO5431在进化上密切相关,其序列未发生明显变异。